4.2. Reannotation of Platforms

Reannotation of the platforms identified several classes of transcripts, most of them being probes representing protein-coding transcripts from Gencode. In addition, we found more than 10,000 non-protein-coding transcripts from the Noncode, LNCipedia, and MiTranscriptome databases (Figure 4.2).

Figura 4.2. Quantidade dos Principais Tipos de Transcritos encontrados em todas as Plataformas. Gráfico de barras representando a quantidade total de cada tipo de transcrito encontrado em todas as plataformas, após a reanotação. Transcritos classificados como “outros” se referem à pseudogenes, imunoglobulinas e RNAs mitocondriais.

Analyzing the proportion of transcript classes in each platform (Figure 4.3), a great variability can be seen both in the total amount and in the proportion of transcript classes found in each platform.

Figura 4.3. Proporção dos Tipos de Transcritos por Plataforma. Gráficos de pizza representando a proporção dos tipos de transcritos encontrados em cada plataforma, após a reanotação. São mostrados a proporção de transcritos codificadores de proteínas (em vermelho), não-codificantes (em amarelo) e outros (verde).